RNA免疫共沉淀（RNA Immunoprecipitation，RIP ）是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術，是了解轉錄后調控網絡動態過程的有力工具，能幫助我們發現miRNA的調節靶點。 RIP這種技術運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，然后經過分離純化獲得結合在復合物上的RNA，再通過高通量測序實現對目的RNA的信息分析。RIP技術與高通量測序的結合，能幫助研究人員更好的了解癌癥以及其它疾病整體水平的RNA變化。

技術路線

圖釋：RIP-sequencing實驗流程（Zhao et al.  Mol Cell，2010）

樣本要求

        樣品類型：RIP實驗分離的RNA樣品

        物種：人、大小鼠（特殊物種詳詢技術支持）

        具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

測序方案

        測序模式PE150

        測序數據量10Gb

生物信息分析內容

        1 原始數據質控檢查

        2 比對結果質控檢查

        3 測序reads全轉錄組分布圖

        4 富集基因的鑒定及定量

        5 富集基因表達及相關通路分析

        6 富集環狀RNA的預測及鑒定

        7 富集環狀RNA宿主基因的通路分析
        8 富集長鏈非編碼RNA表達分析

吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求（2020年version2.2）