小RNA是指一類高度保守的長度為18-32nt的RNA分子，主要包括miRNA、siRNA、snoRNA和piRNA等，是生命活動重要的調控因子，在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。研究表明, 包括癌癥、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。近年來, 由于小RNA測序技術的應用，越來越多的miRNA被發現和功能鑒定,并將廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預后等領域。

技術路線

樣品要求

        樣品類型：細胞、新鮮組織、FFPE組織、血液RNA、血清血漿RNA或外泌體RNA樣品等。

        物種：人、大小鼠（特殊物種詳詢技術支持）

        具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。

測序方案

        測序模式 PE150

        測序數據量 10M reads

生物信息分析內容

        1 miRNA測序分析

        2 原始數據質控檢查；

        3 比對結果質控檢查

        4 新miRNA預測

        5 ncRNA注釋（rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA）

        6 基于miRNA表達的樣品主成分分析

        7 miRNA差異分析

        8 差異miRNA靶基因GO功能分析

        9 差異miRNA靶基因通路分析

        10 差異miRNA與差異表達基因調控分析（如果有mRNA測序結果）

        11 差異miRNA與差異表達基因網絡繪圖（如果有mRNA測序結果）

吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求（2020年version2.2）