小RNA是指一類高度保守的長度為18-32nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA、snoRNA和piRNA等,是生命活動重要的調控因子,在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。研究表明, 包括癌癥、心血管疾病、免疫系統疾病在內的多種疾病與miRNA 的調控作用密切相關。近年來, 由于小RNA測序技術的應用,越來越多的miRNA被發現和功能鑒定,并將廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預后等領域。
技術路線
樣品要求
樣品類型:細胞、新鮮組織、FFPE組織、血液RNA、血清血漿RNA或外泌體RNA樣品等。
物種:人、大小鼠(特殊物種詳詢技術支持)
具體樣品量要求及樣本采集、保存和運輸方法請參照附錄一。
測序方案
測序模式 PE150
測序數據量 10M reads
生物信息分析內容
1 miRNA測序分析
2 原始數據質控檢查;
3 比對結果質控檢查
4 新miRNA預測
5 ncRNA注釋(rRNA / tRNA / snRNA / snoRNA /piRNA)
6 基于miRNA表達的樣品主成分分析
7 miRNA差異分析
8 差異miRNA靶基因GO功能分析
9 差異miRNA靶基因通路分析
10 差異miRNA與差異表達基因調控分析(如果有mRNA測序結果)
11 差異miRNA與差異表達基因網絡繪圖(如果有mRNA測序結果)
吉賽生物NGS樣本采集、保存、運輸要求(2020年version2.2)