RibomovalTM?rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
來源:
|
作者:geneseed
|
發布時間: 2020-11-10
|
362 次瀏覽
|
分享到:
產品簡介
RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) 采用RNase H消化去除人、小鼠和大鼠Total RNA中的細胞質rRNA（28S、18S、5S）和線粒體rRNA（16S、12S、5.8S），以保留circRNA、mRNA和其他非編碼RNA。本試劑盒對于完整和部分降解的RNA（FFPE RNA）均有良好的rRNA去除效果，經rRNA去除所獲得的RNA可用于高通量測序分析，能顯著提高測序結果中有效數據比例。
適用范圍
適用于人、小鼠或大鼠來源的0.1~1 μg Total RNA樣本。
產品特點
樣品廣泛：對于完整和部分降解的RNA（FFPE RNA）均有良好的rRNA去除效果。
高效去除：可有效去除人/小鼠/大鼠的95%~99.9%的rRNA。
數據全面：保留circRNA、mRNA和其他非編碼RNA信息，使轉錄組數據更加全面。
產品組分
注：試劑盒中各組分試劑按照標注體積的110%提供。
運輸與保存
干冰運輸，-30℃~ -15℃ 保存，有效期一年。
案例展示
一、 rRNA去除效果對比
分別使用1 μg Human/Mouse/Rat RNA樣品進行rRNA去除，使用qPCR檢測對比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表達量變化。
圖1顯示Human/Mouse/Rat RNA樣品經rRNA去除后，rRNA基因的表達量CT值遠大于未經rRNA去除的，說明rRNA去除成功。本試劑盒（Geneseed）與K company的效果相當，優于Q company的去除效果。
圖1 rRNA基因的表達量變化
圖2顯示Human/Mouse/Rat RNA樣品經rRNA去除后，mRNA基因的表達量CT值在去除前后基本不變，說明rRNA被去除，而circRNA、mRNA和其他非編碼RNA被保留。本試劑盒（Geneseed）與K company和Q company的效果相當。
圖2 mRNA基因的表達量變化
二、 rRNA殘留率對比
分別使用1 μg 和0.1 μg universal human reference RNA 進行rRNA去除，構建文庫測序后與人類基因組數據庫hg19進行比對。
圖3顯示經rRNA去除后，rRNA殘留率低于5%，本試劑盒（Geneseed）比K company的殘留率更低。
