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自主產品?
RibomovalTM?rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2020-11-10 | 362 次瀏覽 | 分享到:

產品簡介
RibomovalTM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) 采用RNase H消化去除人、小鼠和大鼠Total RNA中的細胞質rRNA(28S、18S、5S)和線粒體rRNA(16S、12S、5.8S),以保留circRNA、mRNA和其他非編碼RNA。本試劑盒對于完整和部分降解的RNA(FFPE RNA)均有良好的rRNA去除效果,經rRNA去除所獲得的RNA可用于高通量測序分析,能顯著提高測序結果中有效數據比例。



適用范圍
適用于人、小鼠或大鼠來源的0.1~1 μg Total RNA樣本。

產品特點
樣品廣泛:對于完整和部分降解的RNA(FFPE RNA)均有良好的rRNA去除效果。
高效去除:可有效去除人/小鼠/大鼠的95%~99.9%的rRNA。
數據全面:保留circRNA、mRNA和其他非編碼RNA信息,使轉錄組數據更加全面。

產品組分

注:試劑盒中各組分試劑按照標注體積的110%提供。
運輸與保存
干冰運輸,-30℃~ -15℃ 保存,有效期一年。

案例展示
一、 rRNA去除效果對比
分別使用1 μg Human/Mouse/Rat RNA樣品進行rRNA去除,使用qPCR檢測對比去除前后rRNA基因和mRNA基因的表達量變化。
圖1顯示Human/Mouse/Rat RNA樣品經rRNA去除后,rRNA基因的表達量CT值遠大于未經rRNA去除的,說明rRNA去除成功。本試劑盒(Geneseed)與K company的效果相當,優于Q company的去除效果。

圖1  rRNA基因的表達量變化

    圖2顯示Human/Mouse/Rat RNA樣品經rRNA去除后,mRNA基因的表達量CT值在去除前后基本不變,說明rRNA被去除,而circRNA、mRNA和其他非編碼RNA被保留。本試劑盒(Geneseed)與K company和Q company的效果相當。

圖2  mRNA基因的表達量變化

二、 rRNA殘留率對比
分別使用1 μg 和0.1 μg universal human reference RNA 進行rRNA去除,構建文庫測序后與人類基因組數據庫hg19進行比對。
圖3顯示經rRNA去除后,rRNA殘留率低于5%,本試劑盒(Geneseed)比K company的殘留率更低。

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