吉賽生物擁有高通量測序、生物信息學、分子生物學、細胞生物學等技術平臺,專注于circRNA相關技術與產品的研發。隨著circRNA研究越來越系統全面,吉賽生物根據不同的需求與角度,將circRNA研究分為八大模塊。
1. circRNA表達分析板塊
1.1 全轉錄組測序
組織或細胞中總RNA去除rRNA后進行高通量測序分析
1.2 circRNA測序
樣品經過RNase R消化去除線性RNA后,進行高通量測序分析
1.3外泌體測序
外泌體樣品全轉錄組測序服務
1.4 高通量數據分析
已完成的高通量測序或芯片數據,或在線高通量測序或芯片數據的表達分析,組織/疾病特異性表達信息挖掘。
1.5 circRNA的QPCR檢測
特定circRNA分子的QPCR檢測服務,包括QPCR引物設計,QPCR檢測。
1.6 circRNA的鑒定
特定circRNA分子的全長鑒定,RNase R耐受性測試等。
2. circRNA功能分析板塊
2.1 circRNA過表達
特定circRNA分子的過表達載體構建,可進行序列插入、缺失、點突變等。包含表達載體、慢病毒等。
2.2 circRNA干擾
設計與驗證circRNA的siRNA,shRNA載體。
2.3 細胞功能研究
細胞增殖實驗(CCK-8、MTT生長曲線分析、克隆形成);遷移侵襲能力測試(劃痕實驗、Transwell實驗);細胞周期檢測;細胞凋亡檢測。
2.4 常規動物實驗
過表達或干擾特定circRNA的腫瘤細胞系,裸鼠成瘤能力測試、瘤轉移能力測試、耐藥動物實驗等。
2.5 定制型circRNA功能研究內容
細胞自噬功能模型、鐵死亡檢測、細胞焦亡檢測等。
3. circRNA表觀轉錄組板塊
3.1 circRNA m6A修飾分析技術
meRIP-seq測序與分析
4. circRNA翻譯-驗證研究板塊
4.1 circRNA中ORF預測分析與驗證
circRNA中潛在的ORF、IRES元件序列分析;構建載體驗證ORF的翻譯情況。
4.2 翻譯組學測序與分析
Ribosome Profiling分析(Ribo-seq),RNC-seq測。
5. circRNA相互作用組學研究板塊
5.1 circRNA-miRNA互作體系
miRNA 結合預測分析:從circRNA預測miRNA,從miRNA預測circRNA,circRNA-miRNA互作網絡分析。
circRNA-miRNA相互作用的驗證:anti-AGO2 RIP檢測,標簽法circRNA pull-down檢測,FISH共定位分析。
5.2 circRNA-蛋白互作體系
RBP結合預測分析,標簽法 circRNA pull-down蛋白質譜檢測或westernblot檢測,PPI互作網絡分析。
5.3 circRNA-lncRNA互作體系
標簽法 circRNA pull-down測序分析或QPCR分析,FISH共定位分析。
6. 功能性circRNA篩選驗證板塊
6.1 高通量circRNA shRNA文庫
SCL-1文庫,篩選模型設計驗證;高通量文庫篩選功能分子;
其他通用型shRNA文庫。
6.2 定制化高通量circRNA shRNA文庫
文庫分子確認,定制shRNA文庫,篩選模型設計驗證,高通量文庫篩選功能分子。
7. circRNA定位分析板塊
FISH定位分析,細胞組分分離后QPCR檢測。
8. circRNA高級結構分析板塊
在線工具預測circRNA的二級結構